Встановлюємо ODBC для Ubuntu:
sudo apt-get update
> sudo apt-get install unixODBC unixODBC-dev
> sudo apt-get install libmyodbc
> sudo gedit /etc/odbc.ini
odbc.ini може виглядати так: [name_of_base]
Driver = /usr/lib/x86_64-linux-gnu/odbc/libmyodbc.so
Description = MyODBC 3.51 Driver DSN
SERVER = localhost
PORT = 3306
USER = user_name
Password = your_password
Database = your_db_name
OPTION = 3
SOCKET = /var/run/mysqld/mysqld.sock
Якщо база знаходиться на віддаленій машині вказуємо сервер і порт, які дозволяють до неї приєднатись.
Вказуємо конфігурацію odbcinst.ini:
> gedit /etc/odbcinst.ini
Приклад odbcinst.ini:
[MySQL]
Description = ODBC for MySQL
Driver = /usr/lib/x86_64-linux-gnu/odbc/libmyodbc.so
Setup = /usr/lib/x86_64-linux-gnu/odbc/libodbcmyS.so
FileUsage = 1
Перевіряємо чи ODBC працює коректно: > odbcinst -j
unixODBC 2.2.14
DRIVERS............: /etc/odbcinst.ini
SYSTEM DATA SOURCES: /etc/odbc.ini
FILE DATA SOURCES..: /etc/ODBCDataSources
USER DATA SOURCES..: /root/.odbc.ini
SQLULEN Size.......: 8
SQLLEN Size........: 8
SQLSETPOSIROW Size.: 8
> echo "select 1" | isql -v name_of_base
+---------------------------------------+
| Connected! |
| |
| sql-statement |
| help [tablename] |
| quit |
| |
+---------------------------------------+
Переходимо в R та встановлюємо пакет RODBC:
> sudo R
> install.packages('RODBC')
І, нарешті, можемо з R працювати з нашою базою:
> library(RODBC)
> connect_to_db <- odbcConnect('name_of_base', uid = 'user_name', pwd = 'password')
Налаштування аналогічного імпорту в PostgreSQL: http://energyfirefox.blogspot.com/2010/12/r-postgres.html
Немає коментарів:
Дописати коментар